G.I. Joe: Wrath of Cobra è un gioco di combattimento a scorrimento che si ispira ai classici degli anni Novanta. Il gioco segue la storia del team G.I. Joe che deve fermare il gruppo terroristico dei Cobra. I giocatori possono scegliere tra quattro personaggi diversi, ognuno con le proprie abilità e mosse speciali.
Il gioco presenta un sistema di controllo complesso e "moderno" con due pulsanti per attacchi "leggeri" e "pesanti", salti e corsa.
Ha dodici livelli, ognuno con nemici diversi e boss da sconfiggere. I giocatori possono raccogliere armi e floppy disk per sbloccare nuovi elementi di gioco. Tuttavia, il gioco ha alcuni difetti, come collisioni imprecise e ripetizioni nei livelli, nonostante questo il gioco è divertente e offre una sfida personalizzabile con diversi livelli di difficoltà.
È consigliato specialmente se si prevede di giocarlo con gli amici, anche se manca l'opzione per affrontare partite online (promessa dal team di sviluppo per un futuro update).