Rola pintar sim. Na verdade isso é muito comum de acontecer, pois como você falou as peças são de uma cor só geralmente.
O ideal é passar um primer e depois pintar por cima, mas não tem problema nenhum se você pintar por cima direto.
A única coisa que você tem que ter cuidado é que como as peças são feitas de plástico, a tinta tem que ser adequada para pintar plástico
Aqui alguns links para te ajudar:
https://all3dp.com/pt/2/como-pintar-pla-impressao-3d/